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荧光定量PCR实验报告-细胞样本

一、实验器材及试剂

1、 实验器材

名称

厂家

型号

多样品研磨珠均质仪

Omni

Bead Ruptor 12多样品研磨珠均质仪

台式高速冷冻型离心机

湖南湘仪仪器开发有限公司

H1850R

荧光定量PCR仪

Roche

LightCycler®480 II

普通PCR仪

杭州晶格科学仪器有限公司

K960

水浴锅

宁波市硕力仪器有限公司

SKE-3S

超净工作台

苏州净化设备有限公司

SW-CJ-1D

组织样本匀浆仪

昂尼仪器

AD18

超微量分光光度计

Thermo

NanoDrop2000

标准试剂型纯水仪

青岛富勒姆科技有限公司

FBZ2001-up-p

离心管

Axygen Biosciences


TIP头

Axygen Biosciences



2、 主要实验试剂及耗材

试剂

厂家

货号

TRNzol Universal Reagent

天根生化科技(北京)有限公司

DP424

三氯甲烷

国药集团化学试剂有限公司

10006818

异丙醇

国药集团化学试剂有限公司

80109218

75%酒精

武汉市雪环医用消毒用品有限公司


EasyScrpt One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix

全式金

AE311-03

Hieff™ qPCR SYBR® Green Master Mix (No Rox)

翊圣生物

11201ES08

QPCR引物

通用生物系统(安徽)有限公司




二、荧光定量PCR实验步骤

1、细胞样本总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)

1)向装有细胞的EP管中加入1ml的TRNzol Reagent,上下颠倒混匀,使其悬浮于TRNzol Reagent。

2)加入200 μl三氯甲烷,剧烈震荡15秒使其充分混匀,液体呈乳状,室温静置3min。

3)4℃ 下12000rpm离心15min,样品会分为3层:粉色有机相,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(约500ul)转移到新的离心管中。

4)在得到的水相溶液中加入等体积异丙醇,混匀,室温放置10min。

5)4℃下12000rpm离心10min,去上清。离心前RNA沉淀是看不见的,离心后在管侧和管底形成胶状沉淀。

6)加入75%乙醇1ml洗涤沉淀,颠倒混匀数次,使沉淀悬浮。

7)4℃下12000rpm离心5min。

8)弃上清,再用小枪头吸净管底乙醇,将离心管置于超净台上吹3min,晾干沉淀(不要晾的过干,RNA完全干燥会很难熔解,大约2-3min即可)。

9)加入适量(20--50ul)的无RNA酶的水溶解RNA。

10)使用Nanodrop 2000检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。

11)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为100ng/μl。


2、普通基因反转录

1)取一PCR管,加入含100ng RNA的溶液8ul,作为反转录的模板。

2)加入2μl 反转录引物Oligo dT。

3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至16ul。

4)依次加入20μl  2×ES Reaction Mix ,2μl  gDNA Remover,和2μl EasyScrptRT/RI Enzyme Mix,用枪抽吸混匀。

5)于放入水浴锅中43℃加热30min,结束后85℃加热5s灭活EasyScrptRT/RI与gDNA Remover。


3、定量PCR

1)取1.5ml EP管,配制如下反应体系,每个反转录产物按照如下反应体系配制3份,并将配制好的反应体系加入96孔PCR反应板中。

Hieff™ qPCR SYBR® Green Master Mix (No Rox)   10.0ul

Forward Primer  1.0μl

Reverse Primer  1.0μl

模板DNA         X

ddH2O  to 20.0μl

2)PCR扩增

预变性95℃,5min

循环(44次)    95℃→15s,55℃→30s,72℃→20s

熔解曲线75℃→95℃,每20s升温1℃


4、结果处理

ΔΔCT法:

A=CT(目的基因,待测样本)- CT(内标基因,待测样本)

B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本)

K=A-B

表达倍数=2e-K