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荧光定量PCR实验报告-液体类样本


一、实验器材及试剂

1、 实验器材

名称

厂家

型号

多样品研磨珠均质仪

Omni

Bead Ruptor 12多样品研磨珠均质仪

台式高速冷冻型微量离心机

DragonLab

D3024R

荧光定量PCR仪

ABI

7300

超净工作台

苏净安泰

SW-CJ-1FD

超微量分光光度计

Thermo

NanoDrop2000

标准试剂型纯水仪

青岛富勒姆科技有限公司

FBZ2001-up-p

离心管

Axygen Biosciences


TIP头

Axygen Biosciences



2、 主要实验试剂及耗材

试剂

厂家

货号

RNA提取液

武汉赛维尔生物科技有限公司

G3013

三氯甲烷

国药集团化学试剂有限公司

10006818

异丙醇

国药集团化学试剂有限公司

80109218

无水乙醇

国药集团化学试剂有限公司

10009218

HyPure TMMolecular Biology Grade Water

HyClone

SH30538.02

RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit

Thermo

#K1622

FastStart Universal SYBR Green Master(Rox)

Roche

04 913 914 001

引物



75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制

离心管、TIP头均购湿热灭菌40min,干燥。


二、荧光定量PCR实验步骤

1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)

1)将血液收集于EDTA抗凝管中,离心取细胞沉淀。

2)取1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷,加入到细胞沉淀中。

3)充分混匀摇匀。

4)12000rpm离心10min取上清。

5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。

6)4℃ 下12000rpm离心10min。

7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。

8)-20℃ 放置15min。

9)4℃下12000rpm离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。

10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。

11)4℃下12000rpm离心5min。

12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。

13)加入15μl无RNA酶的水溶解RNA。

14)55℃ 孵育5min。

15)使用Nanodrop 2000检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2.5μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。

16)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为200ng/μl.


2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶)

1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。

2)加入1μl oligo(dT)18。

3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。

4)于PCR仪上65℃ 保温5min,迅速置冰上冷却。

5)依次加入4μl  5×buffer,2μl  10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。

6)于PCR仪上42℃保温60min,结束后80℃保温5min灭活反转录酶。


3、定量PCR

1)取0.2ml PCR管,配制如下反应体系,每个反转录产物配制3管。

2× qPCR Mix12.5μl

7.5μM基因引物2.0μl

反转录产物2.5μl

ddH2O8.0μl

2)PCR扩增

预变性95℃,10min

循环(40次)    95℃,15s→60℃,60s

溶解曲线75℃→95℃,每20s升温1℃


4、结果处理

ΔΔCT法:

A=CT(目的基因,待测样本)- CT(内标基因,待测样本)

B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本)

K=A-B

表达倍数=2e-K